染料修饰的脱氧尿苷5'-三磷酸（例如氨基烯丙基-dUTP）可用于通过常规酶掺入方法如逆转录，切口平移，随机引物标记或PCR产生含染料的DNA。该酶荧光标记方法广泛用于FISH探针和基于微阵列的实验。该荧光素-dUTP缀合物可用作具有Spectrum Green™过滤器组的绿色荧光颜色（Spectrum Green ™是Vysis的商标）。