染料修饰的（例如氨基烯丙基-dUTP）可用于通过常规酶促掺入方法（例如逆转录，缺口翻译，随机引物标记或PCR）生产含染料的DNA。这种酶促荧光标记方法广泛用于FISH探针和基于微阵列的实验。该香豆素-dUTP偶联物可与Spectrum Aqua 滤光片组合一起用作蓝色荧光色（Spectrum Aqua 是Vysis的商标）。